根據(jù)分析對象，色譜柱的類型，操作儀器的擋次和具體檢測器，若使用不合要求的低純度氣體，不良影響有以下幾種可能：
1）樣品失真或消失：如H2O氣使氯硅樣品水解；
2）色譜柱失效：H2O，CO2使分子篩柱失去活性，H2O氣使聚脂類固定液分解，O2使PEG斷鏈。
3）有時某些氣體雜質(zhì)和固定液相互作用而產(chǎn)生假峰；
4）對柱保留特性的影響：如：H2O對聚乙二醇等親水性固定液的保留指數(shù)會有所增加，載氣中氧含量過高時，無論是極性或是非極性固定液柱的保留特性，都會產(chǎn)生變化，使用時間越長影響越大。
5）檢測器：
TCD：信噪比減小，無法調(diào)零，線性變窄，文獻(xiàn)中的校正因子不能使用，氧含量過大，使元件在高溫時加速老化，減少壽命。
FID：特別是在Dt≤1Ⅹ10ˉ⒒/秒下操做時，CH4等有機(jī)雜質(zhì)，會使基流激增，噪聲加大不能進(jìn)行微量分析。
ECD：載氣中的氧和水對檢測器的正常工作影響最大，在不同的供電工作方式中，脈沖供電比直流電壓供電影響大，固定基流脈沖調(diào)制式供電比脈沖供電影響大。這就是為什么目前諸多在操作固定基流脈沖調(diào)制式ECD時，在載氣純度低時必須把載氣純度選擇開關(guān)從“標(biāo)準(zhǔn)氮”撥到“一般氮”位置的原因。大家會發(fā)現(xiàn)在此情況下操作，不但靈敏度變低，而且線性亦變窄了。實(shí)踐證明：在操作ECD時，載氣中的水含量低于0.02ppm,氧低于1ppm時可達(dá)到較理想的性能。值得指出的是,我們多次發(fā)現(xiàn)由于儀器的調(diào)節(jié)氣路系統(tǒng)被污染而造成的對載氣的二次污染至使ECD基頻大幅度增加使信燥比減小。
FPD和NPD等常用檢測器,由于他們屬于選擇性檢測器,操做時要根據(jù)分析要求,特別注意被測敏感物質(zhì)中雜質(zhì)的去除。
6）在做程序升溫操作時,載氣中的某些雜質(zhì),在低溫時保留在色譜柱中,當(dāng)拄溫升高時不但引起基線漂移還可能在譜圖上出現(xiàn)比較寬的"假峰"。
7）儀器影響
a.各類過濾器加速失效;
b.調(diào)節(jié)閥（穩(wěn)壓閥,穩(wěn)流閥,針形閥）被污染,氣阻堵塞,調(diào)節(jié)精度降低或失靈；
c.氣路系統(tǒng)被污染,若要恢復(fù)儀器在高靈敏度情況下操做,有時要吹洗很長時間（可能一周以上）污染嚴(yán)重時有時再也無法恢復(fù)。
d.檢測器的壽命,實(shí)踐表明,對ECD和TCD的壽命影響最明顯，應(yīng)引起用戶特別注意
垂直回峰指樣品出峰的開始、結(jié)束相對基線呈垂直狀態(tài)，幾乎沒有曲線部分，而正常的出峰形狀應(yīng)為高斯分布。
A.通常是由于氣相色譜儀的調(diào)零不適當(dāng)，氣相色譜儀的零點(diǎn)偏離積分儀或記錄儀、色譜工作站等的工作范圍。
B.一般積分儀或色譜工作站在負(fù)方向的輸入電壓范圍較小，有些積分儀或記錄儀、色譜工作站自身還具有調(diào)零功能，可以進(jìn)行強(qiáng)制調(diào)零。
C.如果氣相色譜儀的零點(diǎn)與積分儀或記錄儀、色譜工作站自身的零點(diǎn)負(fù)向偏離太大，就會出現(xiàn)上述情形，此時請重新對氣相色譜儀進(jìn)行調(diào)零之后再進(jìn)行分析。
使用的氣相色譜儀特點(diǎn)不同，提高檢測器靈敏度的有效手段不同。那么如何提高產(chǎn)品的靈敏度呢？
1、在不分流進(jìn)樣和直接進(jìn)樣時使用：
這種方法需要調(diào)節(jié)柱溫箱，與前者不同的地方是溶劑和分析化合物必須同時在進(jìn)樣時在較冷的色譜柱上冷卻凝結(jié)；
這些凝結(jié)的樣品在色譜柱表面形成“樣品泛濫帶”（floodedzone）；
當(dāng)溶劑逐漸揮發(fā)時，樣品泛濫帶的面積就逐漸縮小，“樣品泛濫帶”分析物的濃度就漸漸增加。
等到溶劑完全揮發(fā)后，分析物就在很小的柱表面范圍上凝結(jié)。
2、當(dāng)不分流進(jìn)樣時，液體的樣品揮發(fā)后，在較冷的色譜柱上冷卻凝結(jié)：
載氣的體積比液體大很多，所以，當(dāng)樣品冷凝結(jié)時，樣品就濃縮在色譜柱的一個小范圍內(nèi)。
所以說不論哪種方法，分析物或是溶劑和分析物必須在柱子的小面積上凝結(jié)。
影響樣品在色譜柱上凝結(jié)速度的因素有：
色譜柱的初始柱溫，溶劑的揮發(fā)性，還有就是色譜柱固定相的比例。
色譜柱柱溫的初始溫度：
1.基本是最容易也是比較快做到的方法，一般說來初始溫度愈低的話，分析物凝結(jié)的愈好。
2.建議初始溫度可以設(shè)在比比較快出峰分析物的沸點(diǎn)低攝氏50度左右，溫度保持的時間可以就是非分流的保持時間。
第二個重要的因素：
色譜柱“固定相比例”（phaseratio）：
愈低的固定相比例，意味著越厚的膜厚，膜越厚樣品和溶劑越容易溶解在固定相。要改變此因素，也只能試試不同的柱子。這是當(dāng)改變初始溫度不可能達(dá)到的時候使用的方法。
最后一個可以改變的因素就是樣品本身：
大部分時候，樣品本身沒法改變，但是，可以使用不同的溶劑以增加其效果，例如，溶劑的沸點(diǎn)與初始溫度的差別愈大愈好，例如，柱溫初始溫度是攝氏30度時，樣品使用的溶劑是乙酸乙酯（沸點(diǎn)攝氏77.1度）會比使用二氯甲烷溶劑好（沸點(diǎn)攝氏39度）。
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