1、生物顯微鏡的安放應選擇干燥清潔的房間，以避免光學部件發(fā)霉、金屬部分生銹以及粘滿灰塵。顯微鏡使用完畢后，即放回箱（柜）內(nèi)，或用玻璃罩、塑料套罩住，并放入干操劑。
2、不要自行拆卸各部件；鏡筒要插上接目鏡或益上鐐苗蓋，避免灰塵從鏡筒上部進入；透鏡表面不要用手指碰觸或拭擦，如有灰塵，先用柔軟毛筆輕輕拂去，再用柔軟的清潔細布拭撩，也可用擦鏡紙蘸少許二甲苯或石油迷試擦，但注意不要在透鏡表面劃出條紋。如鏡片有輕度長霉，用擦繞紙擦不去時，可用棉簽蘸少許70％乙醇與30％乙迷混合液輕輕拭撩。
3、生物顯微鏡不可與腐蝕性酸類、減類或揮發(fā)性強的化學藥品放在一起，以免被腐蝕，縮短使用年限。原則上，當觀察含液體的標本時，一般都要蓋上蓋玻片；若液體中含有酸、堿等腐蝕性化學物質(zhì)時，應把蓋玻片的四周用石蠟或凡士林封住，然后觀察。但由于進行中藥顯微鑒定時，經(jīng)常要用這一類試劑，不可能都封固，因此要特別小心，防止液體流到載物臺上，吏不要沾到物鏡上。
4、生物顯微鏡不應在直射陽光下暴曬，也不要放在靠近爐子或暖氣的地方，以避免過劇的冷熱變化引起透鏡和機件的脫膠、變形或損壞。
5、清潔接物鏡只限于外表面。接物面被藥品污染后即用撩鏡紙蘸少許擦鏡液拭擦（不要用乙醇）；若背面須清潔時，可用柔軟毛筆拂拭，或用皮吸頭吸去灰塵。
6、轉(zhuǎn)動粗細調(diào)比鋁調(diào)焦時，動作要緩慢，不要壓碎蓋被片，以防接物鏡和集光器受控擊而損壞。
7、使用油鏡后，須將鏡頭上的香柏油拭探干凈（可用擦鏡紙蘸少許二甲苯拭擦，但注怠二甲苯不能滲入鏡頭內(nèi)部，否則二甲苯溶解透鏡之間的粘合劑，可使鏡片脫落）。
8、反光鏡鏡面要保護清潔，不要使水、二甲苯或香柏油透入，以免反光鏡的水銀脫落。
9、加機械部分不靈活，可用細綢布蘸二甲苯少鈞：拭去銹和油膩（不得用乙醇，因為這些溶劑會侵蝕油漆），再用少許液體石服潤滑；旋扭過緊不要強行扭動，以免損壞。
10、有時在生物顯微鏡的視野中發(fā)現(xiàn)有污點或異物，可先轉(zhuǎn)動目鏡，如果這些污點跟著旋轉(zhuǎn)，則可確定污點是在目鏡上；否則，可移動標本片，如污點跟著移動，則污點是在標本片上。如果兩者都不是，則污點是在物鏡上，可先撿食物鏡的前鏡頭，然后檢查后鏡頭。根據(jù)不問情況進行清潔處理。
有時視野的一部分不清晰，這可能是物鏡或目鏡的前透鏡表面有指印或灰塵，也可能是標本片做得不好或顯微鏡用法不當，如照明系統(tǒng)末調(diào)好等原因，應查明情況，分別解決。
11、生物顯微鏡用畢后，應將各部分擦拭干凈，格接物鏡轉(zhuǎn)成八字形，然后將鏡筒和集光器下降固定，再將反光鏡的鏡面置垂直的位置。
生物顯微鏡是用來觀察生物切片、生物細胞、細菌以及活體組織培養(yǎng)、流質(zhì)沉淀等的觀察和研究，同時可以觀察其他透明或者半透明物體以及粉末、細小顆粒等物體。
生物顯微鏡的用途：
生物顯微鏡供醫(yī)療衛(wèi)生單位、高等院校、研究所用于微生物、細胞、細菌、組織培養(yǎng)、懸浮體、沉淀物等的觀察，可連續(xù)觀察細胞、細菌等在培養(yǎng)液中繁殖分裂的過程等。在細胞學、寄生蟲學、腫瘤學、免疫學、遺傳工程學、工業(yè)微生物學、植物學等領域中應用廣泛。
生物顯微鏡的使用方法：
先將低倍物鏡的位置固定好，然后放置標本片，轉(zhuǎn)動反光鏡，調(diào)好光線，將物鏡提高，向下調(diào)至看到標本，再用細調(diào)對準焦距進行觀察。除少數(shù)顯微鏡外，聚光鏡的位置都要放在最高點。如果視野中出現(xiàn)外界物體的圖像，可以將聚光鏡稍微下降，圖像就可以消失。聚光鏡下的虹彩光圈應調(diào)到適當?shù)拇笮?，以控制射入光線的量，整理增加明暗差。
生物顯微鏡與金相顯微鏡的區(qū)別在哪里，好多對顯微鏡不熟悉的人會問道這個問題，導致他們在選擇顯微鏡的時候造成一定的困惱，
生物顯微鏡與金相顯微鏡的區(qū)別：
首先他們用來觀察的物體不一樣，金相顯微鏡用于工業(yè)，主要觀察金屬、巖礦等的內(nèi)部組織、及半導體、電子工業(yè)進行晶體、集成電路的檢驗和科學研究。
生物顯微鏡與金相顯微鏡的區(qū)別生物顯微鏡用于學校、醫(yī)院、廣泛應用于生物、病理、細菌、組織、免疫、遺傳等教學、臨應實驗的領域。生物顯微鏡用的是透射照明，一般用來觀察透時和半透明的樣本，不能用來觀察不透明物體，而金相顯微鏡主要是落射照明方式（也叫同軸照明），光源從物鏡射出，主要用于觀察不透明樣本的表面，當然也有附帶透射照明裝置的較高級金相顯微鏡，可同時用于觀察透明樣本。所以在選擇顯微鏡的同時要先了解觀察的物體，根據(jù)不同顯微鏡觀察不同的物體來選配比較適合您的顯微鏡。
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