1、生物顯微鏡的安放應(yīng)選擇干燥清潔的房間，以避免光學(xué)部件發(fā)霉、金屬部分生銹以及粘滿灰塵。顯微鏡使用完畢后，即放回箱(柜)內(nèi)，或用玻璃罩、塑料套罩住，并放入干操劑。
    2、不要自行拆卸生物顯微鏡各部件；鏡筒要插上接目鏡或益上鐐苗蓋，避免灰塵從鏡筒上部進(jìn)入；透鏡表面不要用手指碰觸或拭擦，如有灰塵，先用柔軟毛筆輕輕拂去，再用柔軟的清潔細(xì)布拭撩，也可用擦鏡紙蘸少許二甲苯或石油迷試擦，但注意不要在透鏡表面劃出條紋。如鏡片有輕度長霉，用擦繞紙擦不去時(shí)，可用棉簽蘸少許70%乙醇與30%乙迷混合液輕輕拭撩。
    3、生物顯微鏡不可與腐蝕性酸類、減類或揮發(fā)性強(qiáng)的化學(xué)藥品放在一起，以免被腐蝕，縮短使用年限。原則上，當(dāng)觀察含液體的標(biāo)本時(shí)，一般都要蓋上蓋玻片；若液體中含有酸、堿等腐蝕性化學(xué)物質(zhì)時(shí)，應(yīng)把蓋玻片的四周用石蠟或凡士林封住，然后觀察。但由于進(jìn)行中藥顯微鑒定時(shí)，經(jīng)常要用這一類試劑，不可能都封固，因此要特別小心，防止液體流到載物臺(tái)上，吏不要沾到物鏡上。
    4、生物顯微鏡不應(yīng)在直射陽光下暴曬，也不要放在靠近爐子或暖氣的地方，以避免過劇的冷熱變化引起透鏡和機(jī)件的脫膠、變形或損壞。
    5、清潔接生物顯微鏡物鏡只限于外表面。接物面被藥品污染后即用撩鏡紙蘸少許擦鏡液拭擦(不要用乙醇)；若背面須清潔時(shí)，可用柔軟毛筆拂拭，或用皮吸頭吸去灰塵。
    6、轉(zhuǎn)動(dòng)粗細(xì)調(diào)比鋁調(diào)焦時(shí)，動(dòng)作要緩慢，不要壓碎蓋被片，以防接物鏡和集光器受控?fù)舳鴵p壞。
    7、使用油鏡后，須將鏡頭上的香柏油拭探干凈(可用擦鏡紙蘸少許二甲苯拭擦，但注怠二甲苯不能滲入鏡頭內(nèi)部，否則二甲苯溶解透鏡之間的粘合劑，可使鏡片脫落)。
    8、反光鏡鏡面要保護(hù)清潔，不要使水、二甲苯或香柏油透入，以免反光鏡的水銀脫落。
    9、加機(jī)械部分不靈活，可用細(xì)綢布蘸二甲苯少鈞：拭去銹和油膩(不得用乙醇，因?yàn)檫@些溶劑會(huì)侵蝕油漆)，再用少許液體石服潤滑；旋扭過緊不要強(qiáng)行扭動(dòng)，以免損壞。
    10、有時(shí)在生物顯微鏡的視野中發(fā)現(xiàn)有污點(diǎn)或異物，可先轉(zhuǎn)動(dòng)目鏡，如果這些污點(diǎn)跟著旋轉(zhuǎn)，則可確定污點(diǎn)是在目鏡上；否則，可移動(dòng)標(biāo)本片，如污點(diǎn)跟著移動(dòng)，則污點(diǎn)是在標(biāo)本片上。如果兩者都不是，則污點(diǎn)是在物鏡上，可先撿食物鏡的前鏡頭，然后檢查后鏡頭。根據(jù)不問情況進(jìn)行清潔處理。
    有時(shí)視野的一部分不清晰，這可能是物鏡或目鏡的前透鏡表面有指印或灰塵，也可能是標(biāo)本片做得不好或顯微鏡用法不當(dāng)，如照明系統(tǒng)末調(diào)好等原因，應(yīng)查明情況，分別解決。
    11、生物顯微鏡用畢后，應(yīng)將各部分擦拭干凈，格接物鏡轉(zhuǎn)成八字形，然后將鏡筒和集光器下降固定，再將反光鏡的鏡面置垂直的位置。