1、分析對象的區(qū)別 GC：適于能氣化、熱穩(wěn)定性好、且沸點較低的樣品；但對高沸點、揮發(fā)性差、熱穩(wěn)定性差、離子型及高聚物的樣品，尤其對大多數(shù)生化樣品不可檢測占有機物的20% HPLC：適于溶解后能制成溶液的樣品（包括有機介質(zhì)溶液），不受樣品揮發(fā)性和熱穩(wěn)定性的限制，對分子量大、難氣化、熱穩(wěn)定性差的生化樣品及高分子和離子型樣品均可檢測用途廣泛，占有機物的80% 2、流動相差別的區(qū)別 GC：流動相為惰性，氣體組分與流動相無親合作用力，只與固定相有相互作用?！ PLC：流動相為液體，流動相與組分間有親合作用力，能提高柱的選擇性、改善分離度，對分離起正向作用。且流動相種類較多，選擇余地廣，改變流動相極性和pH值也對分離起到調(diào)控作用，當選用不同比例的兩種或兩種以上液體作為流動相也可以增大分離選擇性?！ ?、操作條件區(qū)別 GC：加溫操作 HPLC：室溫；高壓（液體粘度大，峰展寬?。?/p>
高效液相色譜儀是利用混合物各組分在固定相和流動相中溶解、分配或吸附等化學作用性能的差異，使各組分在作相對運動的兩相中反復多次受到上述各作用力而達到相互分離。高效液相色譜儀在食品分析、環(huán)境分析、生命科學、醫(yī)學檢驗和無機分析等領域得到廣泛使用。一般來說，80%～85%的有機物原則上可采用高效液相色譜儀分析。
一、在食品分析中：
1、食品營養(yǎng)成分分析：蛋白質(zhì)、氨基酸、糖類、色素、維生素、香料、有機酸（鄰苯二甲酸、檸檬酸和蘋果酸等）、有機胺和礦物質(zhì)等分析。
2、食品添加劑分析：甜味劑、防腐劑、著色劑（檸檬黃、莧菜紅、靛藍、胭脂紅、日落黃和亮藍等）和抗氧化劑等分析。
3、食品污染物分析：霉菌毒素（黃qu霉毒素、黃桿菌毒素和大腸桿菌毒素等）、微量元素和多環(huán)芳烴等分析。
二、在環(huán)境分析中：
多環(huán)芳烴（特別是稠環(huán)芳烴）和農(nóng)藥殘留（氨基甲酸脂類，反相色譜）等分析。
三、在生命科學中的應用：
1、低分子量物質(zhì)：氨基酸、有機酸、有機胺、類固醇、卟啉、糖類和維生素等分析。
2、高分子量物質(zhì)：多肽、核糖核酸、酶（胰島素、激素、細胞色素和干擾素等）和蛋白質(zhì)等分析。
四、在醫(yī)學檢驗中：
1、合成藥物：抗生素、抗憂郁藥物和黃胺類藥等分析。
2、天然藥物生物堿：吲哚堿、顛茄堿和強心甙等分析。
五、在無機分析中：
陽、陰離子等分析。
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