在實(shí)際操作中，偏正顯微鏡的上下偏振鏡的振動(dòng)方向要互相正交，或東西和南北方向，各自與目鏡十字絲的橫、縱向一致。有時(shí)只用一個(gè)下偏振鏡來觀測(cè)，必須確定下偏振鏡的振動(dòng)方向，因此操作時(shí)必須對(duì)偏振鏡進(jìn)行校正。
    1、目鏡十字絲的檢測(cè)
    一般要檢查目鏡十字絲是否正交，以及是否與上下偏振鏡振動(dòng)方向一致，同時(shí)選一塊解理極完全的黑云母，移至目鏡十字絲的中心，將解理縫平行于十字絲的一根絲，記下載物臺(tái)的刻度數(shù)，再轉(zhuǎn)動(dòng)物臺(tái)使解理縫平行于另一十字絲，記下載物臺(tái)的刻度數(shù)，兩個(gè)刻度數(shù)之差為90°，說明十字絲正交。
    2、下偏振鏡振動(dòng)方向的確定和校正
    一般用黑云母來檢查下偏振鏡的振動(dòng)方向，這是因?yàn)楹谠颇甘且环N分布廣泛的透明礦物，在單偏光下很有特征。首先找一塊解理和清晰的黑云母，移至目鏡十字絲中心，推出上偏光鏡，轉(zhuǎn)動(dòng)載物臺(tái)一周，觀察黑云母顏色的變化，因?yàn)楹谠颇笇?duì)解理方向的振動(dòng)光吸收較強(qiáng)，所以使黑云母顏色達(dá)到最深時(shí)，解理縫的方向就是下偏光鏡的振動(dòng)方向。
    3、上下偏振鏡正交的校正
    下偏振鏡的方向校正好之后，取下薄片，推人上偏振鏡，觀察視域是否全黑即是否處于消光狀態(tài)。如果全黑，則表明上下偏光的振動(dòng)方向互相正交。否則，上偏振鏡須進(jìn)行校正，即轉(zhuǎn)動(dòng)上偏振鏡，使視域達(dá)到最暗為止。轉(zhuǎn)動(dòng)時(shí)必須先松開上偏振鏡的止動(dòng)螺絲，校正好后再擰緊。

    偏光顯微鏡基本工作原理：

    一、單折射性與雙折射性：

    光線通過某一物質(zhì)時(shí)，如光的性質(zhì)和進(jìn)路不因照射方向而改變，這種物質(zhì)在光學(xué)上就具有“各向同性”，又稱單折射體，如普通氣體、液體以及非結(jié)晶性固體；若光線通過另一物質(zhì)時(shí)，光的速度、折射率、吸收性和偏振、振幅等因照射方向而有不同，這種物質(zhì)在光學(xué)上則具有“各向異性”，又稱雙折射體，如晶體、纖維等。

    二、光的偏振現(xiàn)象：

    光波根據(jù)振動(dòng)的特點(diǎn)，可分為自然光與偏振光。自然光的振動(dòng)特點(diǎn)是在垂直光波傳導(dǎo)軸上具有許多振動(dòng)面，各平面上振動(dòng)的振幅分布相同；自然光經(jīng)過反射、折射、雙折射及吸收等作用，可得到只在一個(gè)方向上振動(dòng)的光波，這種光波則稱為“偏光”或“偏振光”。

    三、偏光的產(chǎn)生及其作用：

    偏光顯微鏡重要的部件是偏光裝置——起偏器和檢偏器。過去兩者均為尼科爾(Nicola)棱鏡組成，它是由天然的方解石制作而成，但由于受到晶體體積較大的限制，難以取得較大面積的偏振，偏光顯微鏡則采用人造偏振鏡來代替尼科爾梭鏡。人造偏振鏡是以硫酸喹啉又名Herapathite的晶體制作而成，呈綠橄欖色。當(dāng)普通光通過它后，就能獲得只在一直線上振動(dòng)的直線偏振光。偏光顯微鏡有兩個(gè)偏振鏡，一個(gè)裝置在光源與被檢物體之間的叫“起偏鏡”；另一個(gè)裝置在物鏡與目鏡之間的叫“檢偏鏡”，有手柄伸手鏡筒或中間附件外方以便操作，其上有旋轉(zhuǎn)角的刻度。從光源射出的光線通過兩個(gè)偏振鏡時(shí)，如果起偏鏡與檢偏鏡的振動(dòng)方向互相平行，即處于“平行檢偏位”的情況下，則視場(chǎng)較為明亮。反之，若兩者互相垂直，即處于“正交校偏位”的情況下，則視場(chǎng)完全黑暗，如果兩者傾斜，則視場(chǎng)表明出中等程度的亮度。由此可知，起偏鏡所形成的直線偏振光，如其振動(dòng)方向與檢偏鏡的振動(dòng)方向平行，則能完全通過；如果偏斜，則只以通過一部分；如若垂直，則完全不能通過。因此，在采用偏光顯微鏡檢時(shí)，原則上要使起偏鏡與檢偏鏡處于正交檢偏位的狀態(tài)下進(jìn)行。

    四、正交檢偏位下的雙折射體：

    在正交的情況下，視場(chǎng)是黑暗的，如果被檢物體在光學(xué)上表現(xiàn)為各向同性單折射體、，無論怎樣旋轉(zhuǎn)載物臺(tái)，視場(chǎng)仍為黑暗，這是因?yàn)槠鹌R所形成的線偏振光的振動(dòng)方向不發(fā)生變化，仍然與檢偏鏡的振動(dòng)方向互相垂直的緣故。若被檢物體具有雙折射特性或含有具雙折射特性的物質(zhì)，則具雙折射特性的地方視場(chǎng)變亮，這是因?yàn)閺钠鹌R射出的直線偏振光進(jìn)入雙折射體后，產(chǎn)生振動(dòng)方向不同的兩種直線偏振光，當(dāng)這兩種光通過檢偏鏡時(shí)，由于另一束光并不與檢偏鏡偏振方向正交，可透過檢偏鏡，就能使人眼看到明亮的象。光線通過雙折射體時(shí)，所形成兩種偏振光的振動(dòng)方向，依物體的種類而有不同。

    雙折射體在正交情況下，旋轉(zhuǎn)載物臺(tái)時(shí)，雙折射體的象在360°的旋轉(zhuǎn)中有四次明暗變化，每隔90°變暗一次。變暗的位置是雙折射體的兩個(gè)振動(dòng)方向與兩個(gè)偏振鏡的振動(dòng)方向相一致的位置，稱為“消光位置”從消光位置旋轉(zhuǎn)45°，被檢物體變?yōu)樽盍?，這就是“對(duì)角位置”，這是因?yàn)槠x45°時(shí)，偏振光到達(dá)該物體時(shí)，分解出部分光線可以通過檢偏鏡，故而明亮。根據(jù)上述基本原理，利用偏光顯微術(shù)就可能判斷各向同性單折射體、和各向異性雙折射體、物質(zhì)。

    五、干涉色：

    在正交檢偏位情況下，用各種不同波長的混合光線為光源觀察雙折射體，在旋轉(zhuǎn)載物臺(tái)時(shí)，視場(chǎng)中不僅出現(xiàn)最亮的對(duì)角位置，而且還會(huì)看到顏色。出現(xiàn)顏色的原因，主要是由干涉色而造成當(dāng)然也可能被檢物體本身并非無色透明、。干涉色的分布特點(diǎn)決定于雙折射體的種類和它的厚度，是由于相應(yīng)推遲對(duì)不同顏色光的波長的依賴關(guān)系，如果被檢物體的某個(gè)區(qū)域的推遲和另一區(qū)域的推遲不同，則透過檢偏鏡光的顏色也就不同。